Oberstes Organ einer Verbandsausgleichskasse ist der Kassenvorstand. Er setzt sich aus Vertretern der Gründerverbände zusammen. Dem Kassenvorstand obliegen insbesondere die interne Organisation der Kasse, die Ernennung des Kassenleiters, die Festsetzung der Verwaltungskostenbeiträge, die Anordnung der Kassenrevisionen und die Genehmigung von Jahresrechnung und Jahresbericht (Art. 58 AHVG).
Der Vorstand der Ausgleichskasse medisuisse setzt sich wie folgt zusammen:
| Dr. med. dent. Jörg Schneider |
Mitglied des Leitenden Ausschusses |
Präsident |
| Dr. med. et lic. iur. Beat C. Bumbacher |
Mitglied des Leitenden Ausschusses |
Vizepräsident |
| Dr. med. dent. Reto Morger |
Mitglied des Leitenden Ausschusses |
| Dr. med. Bettina Balmer-Schiltknecht |
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| Dr. Chiropraktor Hans-Jürg Bieri |
| Dr. med. Roman Graemiger |
| Dr. med. vet. Rolf Jordi |
| Dr. med. Jean-Daniel Schumacher |
| Dr. sc. math. Hanspeter Tobler |
| Herr Patrick Egger |